محافظان مجتبی خامنه‌ای اجازه ندادند پزشکیان با او دست بدهد و دو طرف تنها صدای یکدیگر را می‌شنیدند. منابع می‌گویند پزشکیان این رفتار را تحقیرآمیز دانست و پس از بازگشت حتی این پرسش را مطرح کرد که آیا فردی که با او دیدار کرده، واقعا مجتبی خامنه‌ای بوده است یا نه؛ زیرا فقط صدای او را شنیده بود. مشخص نیست این تردید ناشی از خشم او بوده یا درباره هویت طرف مقابل واقعا ابهام داشته است.

به‌گفته منابع ایران‌اینترنشنال، پزشکیان اخیرا درخواست دیدار دیگری با مجتبی خامنه‌ای در اقامتگاه او را مطرح کرده، اما این درخواست رد شده است.

از زمان انتخاب مجتبی خامنه‌ای به‌عنوان سومین رهبر جمهوری اسلامی حدود پنج ماه می‌گذرد و تاکنون هیچ تصویر یا فایل صوتی رسمی از او منتشر نشده است.

وب‌سایت همشهری ۱۱ مرداد در ویدیویی مدعی شد سرویس‌های اطلاعاتی خارجی می‌توانند با تحلیل فایل‌های صوتی، محل اختفای مجتبی خامنه‌ای و حتی وضعیت جسمی او را شناسایی کنند؛ ادعاهایی که به گمانه‌زنی‌ها درباره وضعیت او دامن زد.

با وجود آنکه دونالد ترامپ سه هفته پیش احتمال کشته شدن مجتبی خامنه‌ای را ۹۰ درصد دانسته بود، نخست‌وزیر اسرائیل اخیرا اعلام کرد او زنده است.

عباس عراقچی، ۱۸ تیر گفت در این دوره مجتبی خامنه‌ای را ندیده و تنها افراد معدودی با او ملاقات کرده‌اند. یک روز بعد، مسعود پزشکیان از افزایش دیدارها با او خبر داد.

همزمان، محمدباقر خرازی، برادر همسر مسعود خامنه‌ای، در ویدیویی که ۱۲ مرداد منتشر شد، مدعی شد مجتبی خامنه‌ای به پزشکیان هشدار داده اگر بار دیگر استعفا کند، این بار استعفایش پذیرفته خواهد شد. او همچنین از برنامه رهبر جمهوری اسلامی برای تغییر در شورای عالی امنیت ملی و تیم مذاکره‌کننده خبر داد و گفت محسن رضایی جایگزین محمدباقر ذوالقدر خواهد شد و به عباس عراقچی نیز گفته شده در مذاکرات مداخله نکند.

خرازی همچنین مدعی شد پزشکیان تاکنون ۲۸ بار استعفا کرده یا تهدید به استعفا کرده است. پیش‌تر نیز ایران‌اینترنشنال به نقل از یک منبع آگاه گزارش داده بود که پزشکیان با ارسال نامه‌ای رسمی خواستار کناره‌گیری از سمت خود شده است. به گفته خرازی، مجتبی خامنه‌ای در اداره امور «تعارفی ندارد» و با قاطعیت وارد عمل شده است.