سيد محمد خاتمي ادعاهاي رسانههاي خارجي مبني بر ملاقات و گفتگوی او با رييس جمهور اسراييل در مراسم تدفین پاپ را بشدت تكذيب كرد. برخي رسانههاي خارچی با انتشار اخباری گفته بودند که سيد محمد خاتمي در جریان مراسم خاكسپاري پاپ ژان پل دوم گفت و گوي كوتاهي با رييس جمهور اسراييل داشته است.
آقای خاتمی جمعه شب پس از بازگشت به تهران دراينباره اظهارداشت که اين ادعا مانند همه ادعاهايي است كه این رسانه ها تا کنون كردهاند و من هيچ ديدار و يا ملاقاتي با هيچ شخصيت اسرائیلی نداشتم.
رييس جمهور کشورمان بااشاره بهمواضع صريح ايران در ارتباط با اسرائیل گفت :بارها اعلام كردهايم كه ما به لحاظ اخلاقي و منطقي، این رژيم را به رسميت نميشناسيم و علت آن اين است كه اسرائيل براساس زور و غصب بوجود آمده است.