مجمع مدرسین و محققین حوزه علمیه قم هم پیام تسلیتی منتشر کرده و در آن نوشته که آقای یزدی "با وجود اختلاف سلیقه ای که با مسئولین نظام داشت، هیچگاه خود را از اصل نظام جمهوری اسلامی و انقلاب جدا نکرد". این مجمع از برخوردهایی انتقاد کرده که در سال های اخیر از سوی حکومت با آقای یزدی صورت گرفته بود.

روابط عمومی حزب اعتماد ملی با انتشار پیامی درگذشت آقای یزدی را تسلیت گفته و غلامحسین کرباسچی، دبیرکل حزب کارگزاران سازندگی آقای یزدی را "یکی از ملی ترین سیاستمداران مسلمان تاریخ ایران" خوانده است.

اما گروهی از منتقدان عملکرد سیاسی آقای یزدی واکنش متفاوتی به خبر درگذشت او نشان داده اند.

گروهی از هواداران حکومت اسلامی با اشاره به عملکرد آقای یزدی و نهضت آزادی در انتقاد از حکومت و رهبران آن، آقای یزدی و همفکرانش را به انحراف از انقلاب اسلامی و "همکاری با بیگانگان" متهم کرده اند.

از سوی دیگر گروهی از مخالفان سرسخت جمهوری اسلامی، از جمله هواداران سلطنت او را به دلیل همراهی با آیت الله روح الله خمینی، رهبر انقلاب ایران سرزنش کرده اند. منتقدان آقای یزدی او را متهم می‌کنند که با دادن مشاوره به آقای خمینی به او کمک کرده که عقاید و اهداف واقعی خود را در جریان انقلاب پنهان کند و افکار عمومی جهان و ایران را فریب دهد.