پیشتر نیز سفر درمانی محمود هاشمی شاهرودی به آلمان خبرساز شده بود. رسانه‌های آلمان ۵ ژانویه / ۱۶ دی از بستری شدن او برای مداوا در کلینیک خصوصی پروفسور مجید سمیعی در شهر هانوفر خبر دادند.

در مدت اقامت هاشمی شاهرودی در آلمان، دادستان این کشور بر اساس شکایت‌های فولکر بک، سیاستمدار آلمانی عضو حزب سبزها، انجمن کردهای مقیم آلمان و انجمن کارگاه پرونده‌ای علیه او تشکیل داد و ایرانیان مخالف جمهوری اسلامی علیه حضور او در آلمان دست به اعتراض زدند.

او سرانجام صبح پنج‌شنبه ۱۱ ژانویه / ۲۱ دی ۱۳۹۶ آلمان را به مقصد ایران ترک کرد و بعد در نشستی خبری درباره وضعیت سلامتش توضیح داد و گفت که مشکل روده داشه، پزشکان داخلی اختلاف داشتند و در آلمان در آلمان پزشکان عفونت دیگری را کشف کردند که در ایران تشخیص داده نشده بود.

در آن زمان برخی رسانه‌های نزدیک به محافظه‌کاران از سفر درمانی او به آلمان انتقاد کردند. به باور محافظه‌کاران منتقد شاهرودی، او نیز می‌بایست مانند دیگر شهروندان بیمار که استطاعت سفر به خارج کشور را ندارند از امکانات داخلی استفاده می‌کرد.

گفته می‌شد که او با گسترش اعتراضات مجبور شده تا دوره درمانی‌اش را رها کند و به ایران بازگردد.

هاشمی شاهرودی از ۲۴ مرداد ۱۳۷۸ تا ۲۴ مرداد ۱۳۸۸ ریاست قوه قضائیه را به عهده داشته است. در دوران ریاست او بر قوه قضائیه بیش از ۲۰۰۰ نفر از جمله تعداد زیادی از متهمانی که هنوز به سن قانونی نرسیده‌اند اعدام شده‌اند.