او در 11 ژانویه 2002 به همراه 20 زندانی دیگر به زندان گوانتانامو منتقل شد. این زندان در همان تاریخ در خاک کوبا افتتاح شد و با نام «کمپ‌ ایکس‌ری» هم شناخته می‌شود. بعدها تصاویری از شکنجه‌ شدید زندانیان در گوانتانامو منتشر شد. در برخی از این تصاویر افراد برهنه شده و آویزان شده و در برخی موارد هم زندانبان‌ها بر گرده زندانیانی که لباس نارنجی بر تن داشتند، سوار شده بودند.

👈مطالب بیشتر در سایت العربیه

پرونده‌های پزشکی نظامی نشان می‌دهد که ابراهیم اسماعیل مدت زمان طولانی در بهداری زندان حضور داشت و روانپزشک ارتش آمریکا اعلام کرد که او به اسکیزوفرنی دچار شده بود. او همچنین مبتلا به فشار خون و بیماری دیابت هم شده بود.

این زندانی سودانی در 18 دسامبر 2013 به کشورش بازپس فرستاده شد. دولت آمریکا در آن زمان به حکم دادگاه فدرال برای آزادی این زندانی زندان گوانتانامو اعتراض نکرد. دادگاه برای آزادی او به بندی از قانون استناد کرد که براساس آن «اگر زندانی به حدی مریض باشد که نتواند به صحنه نبرد بازگردد، باید به کشورش بازپس فرستاده شود.»

وکلای مدافع ابراهیم عثمان در آن زمان اعلام کردند که او به حدی بیمار است که نمی‌تواند برای کسی تهدیدی به شمار رود. دولت آمریکا هم به این موضوع اعتراض نکرد.

یان سی موس دیپلمات سابق آمریکایی که انتقال ابراهیم عثمان ابراهیم ادریس به وطنش را هماهنگ کرد، روز چهارشنبه و پس از مرگ او درباره‌اش گفت: «با توجه به شدت بیماری‌اش روشن بود که در خانه‌اش و در کنار خانواده‌اش به بهترین شکل ممکن از او مراقبت می‌شود.»

ابراهیم عثمان در زمانی به کشورش بازگردانده شد که سودان هنوز در فهرست کشورهای حامی تروریسم حضور داشت. سودان در آخرین ماه‌های دولت دونالد ترامپ از این فهرست خارج شد.