محمدحسین بیات در بخش دیگری از سخنان خود ابراهیم رئیسی را متهم کرد که هر بخشی از دولت را «به نماینده یکی از باندهای فاسد و یا ناکارآمد قدرت و ثروت بذل و بخشش کرده» و در نهایت «امنیتی‌ترین کابینه جمهوری اسلامی را با انتصاب سرداران سپاه در تک‌تک مناصب دولتی تشکیل داده» است.

پرونده‌سازی‌ قوه قضائیه برای دانشجویان، اساتید دانشگاه و پژوهشگران در زمان ریاست ابراهیم رئیسی بر این نهاد، سرکوب شدید اعتراضات آبان ۱۳۹۸، «فساد سیستماتیک، نظامی‌گری افسار گسیخته، فقر شدید اقتصادی، شکاف سرسام‌آور طبقاتی، از هم گسیختگی اجتماعی، تحریم‌های بین‌المللی، مسائل و کلان‌مشکلات زیست محیطی» در ایران از دیگر انتقادات نماینده این تشکل دانشجویی به رئیسی بود.

انتشار این سخنان موجب واکنش شماری از هواداران دولت شد و آنها از بسیج دانشجویی خواستند پاسخ‌های «منطقی و مناسب» به آنچه «اتهامات» علیه دولت رئیسی نامیدند، بدهد.

این در حالی است که بسیج دانشجویی دانشگاه صنعتی شریف در کانال تلگرامی خود نوشته است که «با اقدام لحظه‌ آخری تیم نهاد ریاست‌ جمهوری و مخالفت با فعالیت افراد رسانه‌ای حاضر در جمع»، آنها نتوانستند این مراسم را به صورت زنده پوشش دهند.

در اطلاعیه این گروه دانشجویی همچنین آمده که هماهنگی و تخصیص تریبون‌های سخنرانی گروه‌ها و نمایندگان تشکل‌ها «طبق طراحی نهاد ریاست‌ جمهوری صورت گرفته» بود.

بسیج دانشجویی دانشگاه صنعتی شریف در عین حال وعده داده که به زودی «روایتی از ناگفته‌ها و ابهامات موجود» در ویژه‌برنامه روز دانشجو با حضور رئیسی را منتشر خواهد کرد.

حضور محمدباقر قالیباف در جلسه دیگری که به منظور روز دانشجو برگزار شده بود نیز با طرح انتقادهای بسیاری علیه وی در مجموعه شهرداری تهران و مجلس شورای اسلامی مواجه شد.