در مذاکرات در حضور رهبری همه تلاش این بود که در پرونده قتلهای زنجیره ای قاتلان را و بخصوص سعید امامی را از عوامل شبکه جاسوسان خارجی بشناسیم که دلیلی برای آن‌ ارائه نشد و تحلیل آقای محمد نیازی رئیس سازمان قضایی نیروهای مسلح هم ضعیف است آقای خاتمی پیشنهاد کرد که رهبری بیانیه ای در مورد خودکشی او بدهند که موافقت نشد.

در مسیر خانه آقای سیدمحمد خاتمی رئیس جمهور در ماشین من سوار شدند از رهبری گله داشت که در مورد مساله ۱۳ یهودی متهم به جاسوسی سختگیری کرده اند و اجازه دخالت دولت و شورایعالی امنیت ملی در حل مشکلاتشان را ندادند و دستور اجازه آزادی چند نفر از آنها را که آقای خاتمی داده است لغو کرده اند.

آقای خاتمی برای آرام کردن جو تند جهانی به مدیر اطلاعات گفته بود که بعضی از ۱۳ یهودی که اتهاماتشان مستدل نیست آزاد شوند که رهبری با آن مخالفت کرده اند و گفته اند که به مدیر بگوید دستور لغو شده است. آقای خاتمی خواهش کرد که رهبری خود این را به آقای یونسی بگویند و ایشان فورا از طریق آقای سید علی اصغر حجازی دستور لغو آن‌ را داده اند.

من سر شام پیشنهاد کردم که مساله جاسوسان یهودی به شورایعالی امنیت ملی واگذار شود رهبری نپذیرفتند بعدا معلوم شد به خاطر همین موضع، و دستور آقای خاتمی در مورد آزادی بعضی از آنهاست معتقدند محکم باید ایستاد.