محمد سرافراز در حساب کاربری توییتری خود نوشت: «مأموران حکومتی که مردم بی‌سلاح و زنان و کودکان بی‌دفاع را می‌کشند و آمرانی که فرمان می‌دهند، قاتل هستند. آنها هم در این دنیا و هم در دادگاه عدل الهی به سزای عمل‌شان خواهند رسید».او بعد از پایان ریاستش در صدا و سیما دیدگاه انتقادی نسبت به حاکمیت از خود نشان داد . او پس از اعتراض‌های اخیر پیام های انتقادی زیادی در حساب کاربری توییتری خود علیه حاکمیت نوشته است.

همچنین پیشتر نیز سازمان اطلاعات سپاه را در برنامه اینترنتی « اتاق شیشه‌ای» به کارشکنی در مبارزه با فساد متهم کرده بود. سرافراز در این برنامه گفته بود برنامه‌های او برای مبارزه با فساد و رانت در صدا و سیما باعث شد با او برخورد کنند.