حسین طائب در دهه ۶۰ سمت‌هایی در سپاه استان‌های تهران و قم داشت و برخی سابقه آشنایی او با مجتبی خامنه‌ای را مربوط به دوره جنگ می‌دانند. او سپس وارد وزارت اطلاعات شد و به سمت مدیر کلی رسید و در یک پرونده مرتبط با پسر اکبر هاشمی رفسنجانی برکنار شد.

خبرگزاری فارس چهارم دی ماه ۱۳۹۲ در گزارشی درباره مهدی هاشمی نوشته بود "حسن طائب" از "مدیران وقت ضدجاسوسی وزارت اطلاعات، پرونده‌ای برای یکی از فرزندان هاشمی تشکیل داد. با اطلاع هاشمی رفسنجانی، رئیس‌جمهور وقت، طائب از وزارتخانه اخراج و به دلیل همین برخورد چکشی، وی مدتی خانه‌نشین شد".

اشاره این خبرگزاری به موضوع بازداشت عباس یزدان‌پناه یزدی، بازرگان ایرانی‌ـ‌بریتانیایی و از افراد نزدیک به مهدی هاشمی است که در دهه ۷۰ با دستور طائب بازداشت و از او اعترافاتی علیه مهدی هاشمی گرفته شد. این اعترافات سال ۱۳۹۴ و سال‌ها پس از بازداشت او توسط خبرگزاری تسنیم وابسته به سپاه پاسداران پخش شد.

عباس یزدان‌پناه یزدی در تیرماه سال ۱۳۹۲، چند ساعت پس از آنکه از دوبی از طریق ارتباط ویدیویی در دادگاه رسیدگی به یک پرونده بین‌المللی در لاهه شهادت داد، ناپدید شد و گفته می‌شود که ربوده شده است.

همسر این بازرگان نیز احتمال داده بود که ربوده شدن او به جنگ قدرت تندرو‌ها و میانه‌رو‌ها در ایران ربط داشته باشد، چون همسرش با مهدی هاشمی، پسر اکبر هاشمی رفسنجانی، رئیس مجمع تشخیص مصلحت نظام دوستی داشته است.

براساس روایت‌های مقامات جمهوری اسلامی، طائب پس از اخراج از وزارت اطلاعات، در اطلاعات موازی که در دولت محمد خاتمی و با مدیریت اعضای دفتر رهبر جمهوری اسلامی تشکیل شد، فعالیت می‌کرد.

محمود احمدی‌نژاد، رئیس جمهور پیشین، نیز گفته بود حسین طائب از وزارت اطلاعات "بیرون انداخته شد برای اینکه دو به‌هم‌زنی می‌کرد بعد بردندش جای دیگری به او اختیارات تام دادند بدون قانون".

پیش از انتخابات ریاست جمهوری سال ۱۳۸۴ نام حسین طائب با عنوان "میثم طائب" مطرح شد و گفته شد که او در کنار مجتبی خامنه‌ای ابتدا برای پیروزی محمدباقر قالیباف تلاش می‌کرد اما بعد به نفع احمدی‌نژاد فعالیت کرد.

با این حال محمود احمدی‌نژاد گفته بود که او در آن انتخابات به نفع نامزد دیگری فعالیت می‌کرده است.

اسفندیار رحیم‌مشایی، رئیس دفتر محمود احمدی‌نژاد گفته بود که آقای طائب در سال ۱۳۸۴ تلاش کرد وزیر اطلاعات شود اما احمدی‌نژاد با انتصاب او به این سمت مخالفت کرد.

آبان سال ۱۳۸۶ محمدعلی جعفری، فرمانده کل سپاه و نیروی مقاومت بسیج، آقای طائب را به عنوان جانشین خود در این نیرو معرفی کرد. او در ۲۳ تیر ۱۳۸۷ به عنوان فرمانده نیروی مقاومت بسیج منصوب شد و حسن فیروزآبادی، رییس ستاد کل نیروهای مسلح، از او به عنوان فردی نام برد که "می‌تواند بسیج مدنظر فرمانده معظم کل قوا را سازماندهی و آماده کند".

سپس آیت‌الله علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی ایران، ۱۳ مهر ۱۳۸۸ با صدور حکمی محمدرضا نقدی را به سمت رئیس سازمان بسیج منصوب کرد و آقای طائب به عنوان معاون اطلاعات سپاه پاسداران منصوب شد. در آن سال ساختار اطلاعات سپاه پاسداران تغییر کرد و این مجموعه به سازمان تبدیل شد.

طائب در مقام فرمانده نیروی مقاومت بسیج و معاون اطلاعات سپاه پاسداران نقش جدی در سرکوب اعتراضات سال ۱۳۸۸ داشت.

علی مطهری، نماینده مجلس، گفته بود: "وقتی ما مدیریت بحران اخیر را به دست افرادی مانند طائب می‌دهیم که با باتوم بیشتر مأنوس است تا فکر و عقل و تدبیر، نتیجه همین خواهد بود".

در همان سال، مهدی کروبی نامزد انتخابات سال ۱۳۸۸ در نامه‌ای طائب را به تدارک دیدن "نمایش خود ساخته" در ماجرای ترانه موسوی متهم کرد.

پس از گزارش‌ها درباره کشته شدن دختری به نام ترانه موسوی، تلویزیون فیلمی از یک خانواده که نام عروس‌شان ترانه موسوی بود و در کانادا زندگی می‌کرد پخش کرد که این موضوعات را تکذیب کردند.

حسین طائب داماد علی‌اکبر حسینی مشهور به "حسینی اخلاق در خانواده" بود و براساس نوشته کروبی، حسین شاه‌مرادی باجناق طائب، برادر همسر ترانه موسوی بود که در این فیلم خبر زنده بودن او داده شده بود.

پس از دولت حسن روحانی، سازمان اطلاعات سپاه پاسداران به ریاست طائب هم با نزدیکان آقای احمدی‌نژاد به خصوص اسفندیار رحیم‌مشایی و حمید بقایی و هم با نزدیکان حسن روحانی به خصوص حسین فریدون برخورد کرد.

سال ۱۳۹۳ گزارشی در سایت سحام نیوز منتشر شد که اعلام شده بود سازمان اطلاعات سپاه پاسدارن از مدتی پیش و با استفاده از بودجه و امکانات عمومی، اقدامات گسترده‌ای را برای "زمین‌گیر کردن دولت یازدهم" در دست انجام دارد.

سازمان اطلاعات سپاه پاسداران در دولت روحانی همچنین تعدادی از شهروندان دو تابعیتی را بازداشت کرد.